Un buen sistema de ficheros es aquel que no es necesario desfragmentarlo (Wikipedia), los ficheros intentan ordenarse cada vez que se escriben en disco y no como hacen los sistemas de ficheros de windows, que necesitan desfragmentarse.
Últimamente he probado un desfragmentador en mi equipo y en casas de amigos con resultados excelentes de velocidad en el arranque y luego al acceso de aplicaciones se llama jkdefrag (licencia GNU) y lo podéis descargar aquí.
Si quieres saber mas sobre la fragmentación y sistemas de ficheros sigue leyendo. También puedes descargarte este powerpoint que hice hace tiempo
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